A meta do I Workshop de Síntese e do III Simpósio foi definir o conteúdo de um livro que sintetizasse os conhecimentos gerados ao longo dos cinco anos do Programa Biota/Fapesp. O objetivo central será a discussão de temas e organização de grupos de trabalho que, ao longo do próximo ano, trabalharão para a concretização do livro que deverá ser publicado ao final de 2003. 
Mais do que uma coletânea de textos este livro se propõe a evidenciar as contribuições que o Programa trouxe para as pesquisas em caracterização, conservação e uso sustentável da biodiversidade do estado de São Paulo e que só foram possíveis graças ao seu formato.

Para isso, os pesquisadores participantes foram divididos em 6 Grupos de Trabalho, que contaram com dois coordenador(es), um relator e um "provocador". Cada GT eleaborou um relatório a partir das discussões realizadas durante o evento, esses relatórios estão disponíveis em formato PDF.

1. Inventários bióticos: o que mudou no estado do conhecimento de 1997 a 2002 - cobertura taxonômica, biogeográfica e ecológica 
   Coordenadores: Carlos E. M. Bicudo e Cláudio G. Tiago 
   Provocador: George Shepherd 
   Relatório GT-1
   
   
2. Conservação - avaliação do conhecimento e indicadores 
   Coordenadores: Lilian Casatti e Jean Paul Metzger 
   Provocador: Luciano Verdade 
   Relatório GT-2
   
   
3. Correlação, integração e análise de padrões de distribuição 
   Coordenadores: Paulo Inácio Prado e Flávio M. Santos 
   Provocador: Rui Cerqueira 
   Relatório GT-3
   
   
4. Aplicações: prospecção, sustentabilidade 
   Coordenadores: Alberto Cavalhero e Giselda Durigan 
   Provocador: Glaucis Oliva 
   Relatório GT-4
5. Aplicações: divulgação, educação, turismo 
   Coordenadoras: Maria Cecília W. Brito e Cecília Amaral 
   Provocador: Marcos Sorrentino 
   Relatório GT-5
   
   
6. Biodiversidade e funcionamento de ecossistemas 
   Coordenadores: Plínio Camargo e Denise Bicudo 
   Provocador: Fábio Sacarano 
   Relatório GT-6